En la Garrotxa hay dos tipos de paisaje vegetal muy diferentes: el mediterráneo, caracterizado por la presencia de encinas, y el centroeuropeo de carácter atlántico, con hayedos y robles de varias especies. En cuanto a la flora, sólo en el Parque Natural de la Zona Volcánica de la Garrotxa hay identificadas más de 1.170 especies de plantas superiores, y en el que se pueden encontrar varias plantas muy raras en el conjunto de la flora catalana.
Esta diversidad de ambientes presente en la Garrotxa propicia que la fauna de la comarca también sea muy diversa, y contenga especies de gran interés, sobretodo de invertebrados. En el Parque Natural de la Zona Volcánica de la Garrotxa se sabe que hay casi 300 especies diferentes de vertebrados, 52 de las cuales corresponden a mamíferos, 198 a pájaros, 13 a anfibios, 18 a réptiles y 11 a peces. En lo que a invertebrados se refiere, hay registradas más de 164 especies de invertebrados no artrópodos, 20 de artrópodos no insectos y más de 1.000 de insectos.